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据中国科学文献计量评价研究中心等编制的《中国学术期刊影响因子年报（自然科学与工程技术·2023版)》统计结果，《植物营养与肥料学报》2022年度复合类影响因子为4.541，五年影响因子为5.402，影响力指数(CI）在22种农业基础科学期刊中排第2，在51种农艺类期刊中排第1，均处于Q1区。
据中国科学技术信息研究所编著的《2023年版中国科技期刊引证报告（核心版）自然科学卷》统计结果，《植物营养与肥料学报》2022年度核心影响因子2.974，核心总被引频次7197，综合评分在“土壤学”期刊中均排名第2。
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